上部过滤器
它是安放在水族箱上面的一种过滤器，利用水泵将水族箱中的水抽至过滤器的一端，进入过滤器中的水即沿着过滤器通过滤材最后到达另端，由底部口落入水族箱中，形成循环。由于此种过滤器的深度不高，容积很小水似乎没有什么压力，要求滤材有极好的通透性，否则易于堵塞。由于容积小，过滤能力有限，所以饲养的鱼儿不能多，更不能饲养软体动物。
底部过滤器
这种过滤器大部份是自制的。将带有布满孔隙的塑料管围成闭合的管道网，在一端设有竖直的水管，能将水引出到水族箱中，在闭合的管道网上面铺设一块漏水板，在漏水板上面再铺一层尼龙网，在尼龙网上方铺满厚为5cm—10cm的细粒珊瑚砂做为过滤材质。但由于珊瑚砂层不可太厚，而且易于形成板结死角，清洗也较困难，饲养量不能太多，有些鱼还喜欢挖洞穴，使尼龙网和漏水板暴露造成水流的短路现象。所以底部过滤器是一种低效率的过滤系统，很少单独使用，有时为了造景及增加对底部的珊瑚的处理偶而也有加用底部过滤器。
主要组成部分：珊瑚砂、尼龙网、漏水板、带孔的集水管和竖管。
下部过滤器（溢流式过滤器）
这是置于水族箱支架下面的过滤器，由上下的连结是通过二根管子，一根是穿过水族箱的底部直插在过滤器中，当水族箱中的水面超过管子的顶部时就会通过管子溢流到下部过滤器中，下部过滤器可以设有滴流式过滤及各种机械、生物、吸附过滤。经过过滤的水再由水泵提升到上面的水族箱中形成循环。由于进水口及出水口的位置较高，在停电时不会发生倒流现象。
主要组成部分：水族箱、下部过滤器、溢流出水管、进水管、生化球滴流式过滤、滤材、水泵和雨淋式进水管。
桶状缸外过滤器
由一密闭带泵的过滤桶和不同滤层的滤盒组成。放便实用。
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