由于信鸽没有牙齿，它们无法如哺乳动物般咀嚼食物混合唾液咽下。而是经过食道至嗉囊和水调和再进入含有消化酵素的腺胃，通过砂囊收缩分解食物为更小的份子。砂囊, 这里即是砂砾的所在,，这些都是非常小的圆石， 信鸽将之咽下让其成为类似磨石的作用。谷物一旦磨成如浆后再推入消化道最大的部份： 小肠。我们知道在小肠的尾端有两个阑尾,，肠终止在泄殖腔,，自然地变宽。 在这个临界点之前， 大部分的液体被再吸收及回到血管。
在2条输尿管直通泄殖腔不断地排尿至粪便中， 这水气同样地被再吸收。母鸽的输卵管连通泄殖腔，公鸽则是输精管与之相接。
信鸽的粪便通常是固形的、黄褐色在其表面上的白色物是粘滞的尿液。
倘若粪便是流体的，可能是太快经过肠道因此仍含有太多水分，同样地可能是功能不良或生病而阻碍水气被再吸收，亦可能是过多的尿液被排出。
当消化物经过肠道时会有来自肝脏和胰脏的额外物加入食物内，之后加上特殊的酵素负责分解碳水化合物； 而在另一方面肝脏分泌胆汁。
胆汁功能把脂肪分解渗入肠壁和血管。信鸽与鸡不同， 它没有胆囊，即使在肠和胃道那儿没有食物，胆汁仍然会不断地制造。这即是为何信鸽有时没有吃食却也能排出绿便的原因， 换言之信鸽出现绿便并非是生病而是信鸽有段时间未进食。这同时也说明了为何信鸽于长远程飞行返巢后排绿便。
肠菌改变肠和胃道内的东西如谷物， 加上水和许多酵素，这样的过程使得它们可以被吸收进入血管内。不同种类的细菌大都是用来分解和消化食物。 没有这些‘肠内微生物’信鸽就会饿死。所有的动物都有肠菌，假使某种细菌过量则会消化不完全而动物呈现饮食不足的现象。
一羽健康的信鸽于正常喂食状态下总是会有适当的肠内微生物。小心不要颠覆了这样的状态。