在夏季，尤其是温度高于30℃以上，牡丹鹦鹉最易出现“肿眼”病，有些人不明病因，瞎喂消炎药和软膏类药物，不但不见好转，反而怡误病情，造成百分之九十以上鸟死亡，经常损失惨重。
肿眼病和一般鸟眼发炎，外伤红肿不同，初发现眼病时鸟体内部患病已有十天左右，如果解剖鸟体，鸟体内部的脏器肝、肠或其他部位已有出血点，有发生霉烂之现象。再看眼，眼的里面含有泪水，身体明显消瘦、乍毛、厌食或贪食，还有的鸟产生拉稀现象，拉稀的粪便形状为绿条状，周边为水样，这些病是鸟衣原体病毒所致。
鸟衣原体病毒还有的导致鸟喘粗气，呼吸时有隔咳音，肺部有湿罗音，大鸟脾气急躁，在伏窝时出现啄羽现象和咬死小鸟，看小鸟则翅部和腹部有紫色的血斑和血块，小鸟的毛还未长齐则被啄死。遇到这种情况，必须索找病因，其病因就是衣原体病毒和缺硒和钼所致。见到这种情况，应马上将病鸟隔离，对病鸟和其他鸟都要进行消毒，消毒液以北京爱鸟协会专家自行配制、效果显著。
哺药需特别注意，一般的药都不对症治疗，如眼药水、眼药膏，不但治不好病，反而起反作用，造成病情加重，使眼肿胀，并起到促进肿眼作用，眼会肿胀并封起来，封起来后严重者则眼失明，或有白色朦质物质，眼皮带肉疚或白花色分泌物，鸟得肿眼病造成鸟体突然死亡非常平常，以前对其病因已知，但对治疗方法掌握甚少，经过几年的研究，北京爱鸟养鸟协会专家自行配制的胶囊6号，胶囊7号收到显著效果。
胶囊6号，治疗消瘦、乍毛、起眼、眼流泪、眼红肿，衣原体病毒感染初期。此胶囊为红黄胶囊。使用方法：将一粒胶囊打开，把药末（注意晶体状，黄白颜色，防止假冒）放入杯内。用2毫升凉白开水将药末溶化，此药液医治病鸟一只。即一只病鸟每天喂1粒胶囊药。这两毫升液分三次喂（每次10滴），同时再往眼上滴2滴，总共每次14滴，三次共42滴即2毫升。若没有起眼，可不滴眼，分三次喂嘴中，喂完为止。一病鸟连续三天，即三粒胶囊就可显著见效。
胶囊7号，治疗喘、掉毛不好、脱毛不正常、不长毛和母鸟咬小鸟、咬毛。7号使用方法同样，也是将2毫升凉白开水溶药胶囊1个，每天喂1粒胶囊的药，分早、中、晚三次喂，每次喂0.65毫升，连喂3天，连喂3个胶囊即在服药后见效。气喘及拉稀状可当日看出结果，长毛、掉毛现象十天后发生明显变化。为防假冒，此两种药已报专利，只在爱鸟协会和野生动物保护协会专点供应，特在此告之广大养鸟爱好者，以防上当受骗。
凡发现肿眼者，室内、笼具、食罐、水罐包括空气都要消毒，以防迅速传染 。
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