兔子是草食性动物Herbivores。他们主要是吃素食这一类高纤维的食物。因此兔子的消化系统与人类的消化系统相比，有很大分别。兔子的消化系统约占身为重量的10～20%。他们的消化道也有特殊的构造，以令到难以消化的草食得以分解、发酵、转换成可吸收的营养。
进食的整个过程应该是由嘴巴开始。由于兔子的前肢不能握紧食物，兔子主要是利用舌头把食物拉过来，再用门牙Incisors（六颗门牙:四颗在上颚、二颗在下颚）把食物切成小块。之后，食物会传送到臼齿Molars（十颗前臼齿:六颗在上颚、四颗在下颚）（十二颗臼齿:六颗在上颚、六颗在下颚）磨碎吞下，进入食道。
食糜经过食道Esophagus就会进入胃部Stomach。兔子的胃部很大，为单室胃，形状成红腰豆形。胃壁很薄，也欠伸缩性，所以兔子是不会呕吐。兔子胃部的位置在横膈和肝的后方，腹腔的前部，下接十二指肠Duodenum。胃部可以分为二个部份，包括Fundus和Pylorus。Fundus并没有分泌腺；而Pylorus就会分泌胃液Hydrodoric acid、消化酵母Digestive enzymes和黏液Mucus。酸碱度为1.5至2，即带酸性。十五天以下的兔子，胃酸分泌会比较少，所以他们对消化一般饲料中蛋白质的能力也会比较差；但会他们的胃部有一种凝乳酵母，作用是有助消化母乳。胃部的主要作用是贮存食糜，引导食糜进入小肠中作进一步的消化和吸收。 小肠是整个消化过程最主要的部份。果糖Fructose、大部份的淀粉质Starch和90%蛋白质Protein也在小肠中吸收的。
小肠包括十二指肠Duodenum、空肠Jejunum和回肠Ileum。十二指肠的形状像“U”型，上接胃部。酸碱度为7.2，即带碱性，为了中和那些从胃部进入的酸性食糜。十二指肠内有从胰脏分泌的消化酵母Pancreaticenzymes和胆汁Bile。这种胰脏分泌的消化酵母有助消化碳水化合物、蛋白质和脂肪。而胆汁对维他命和脂肪的吸收也很重要。经过十二指肠，食糜会进入空肠。空肠是消化和吸收的重要部份。进入空肠之后，食糜会进入回肠。
大肠可分为盲肠Caecum、结肠Colon和直肠Rectum三个部份。在回肠和大肠的交界位置，不能消化的纤维就会直接被推进结肠colon再进入直肠，结肠和直肠会吸收食糜中的水分和无机盐，形成硬的球粪。而可以继续消化的物质，就会进入盲肠中作进一步分解。兔子的盲肠非常之发达，长度与兔子的身长相约，容量占整个消化道的一半。盲肠内有大量的微生物和益菌，有助分解拥有厚细胞壁的植物细胞，把未完全消化的食糜发酵，转化成可以吸收的养份。进入盲肠的食糜大多是半液态。由于在盲肠中的食糜经过发酵后，就会立即排出，形成盲肠便Cecotropes。因此盲肠便都是比较湿的。
一般兔子进食后三至六小时，才会排出盲肠便。由于兔子通常是黄昏进食，因此他们大多会在晚间才排出盲肠便。盲肠便是湿湿软软的，由黏膜包围，带啡绿色，有时候会连起成串状，就像葡萄的样子，因此又称葡萄便。盲肠便相比一般硬便来说，含很高营养。因为盲肠便是需要再一次进入消化系统再吸收利用，所以兔子会有吃盲肠便的行为。吃盲肠便反而是兔子正常的行为。如果兔子停止吃盲肠便，就可能是生病了。一般兔子排出盲肠便的数量是粪便总数的50%～80%，大多会当兔子在肛门排便时立即再次给吃掉。至于软便的数量是有差异性，有多也有少，也在于兔子吃什么的食物。如果软便太多，软便甚至会黏在兔子的身上，就可能是因为摄取纤维不足或吃的东西难以消化。
硬粪（正常） 软粪（盲肠便）
Dry Matter 53% 39%
粗蛋白质 14% 32%
粗脂肪 35% 22%
无氮浸出物 38% 35%
无机盐 9% 11%
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