在身体状况方面，呼吸道或心肺系统不好的宠物，或是有心脏病、糖尿病等慢性病，容易在这个季节发病；另外，因为受夏天蚊子叮咬所带来的心丝虫也逐渐成虫，在秋、冬时就会开始影响宠物的健康。主人要特别注意宠物的日常作息，一有异常状况，就要尽快送医。
秋天更是壁虱繁殖的季节，可能会在宠物身上引起皮炎、脱毛等症状，常常出门或接触草皮的宠物，要事先做好防蚤、防壁虱的处理。
小型哺乳类动物，如兔子、黄金鼠、猫咪等，或是小型犬，如吉娃娃、玛尔济斯，以及刚出生不久、断乳一至三个月的小动物，因为抵抗力较差，加上气温变化大，生病的几率都会比其他宠物高。
这个季节，为宠物保暖的工作显得最为重要。例如为宠物准备床垫、毯子，或是把门窗关小一点，都是保温的方式。
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