一忌用塑料袋装。塑料袋不透气，在缺氧的条件下，种子进行无氧呼吸，产生大量的有毒物质，能杀死种胚；在塑料袋中，种子呼吸产生的水分和热量散发不出去，容易使种子发热霉变而不发芽。
二忌接触地面。地面湿度大，为防止种子受潮而降低发芽率，不管麻袋、布袋及其他容器，都不宜直接堆放在地面上，最好用砖或木板垫高50厘米左右。
三忌虫蛀。种子在贮藏期，会被多种病虫蛀食，避免的方法是尽量使种子干燥，创造不利害虫生存的环境，可利用晴天中午暴晒种子，消灭害虫。
四忌混杂。种子收获后要及时贴标签，注明品种和收获日期，切忌混杂。
五忌与农药、化肥混存。农药与化肥大多数有挥发性和腐蚀性，如果与种子同室贮藏，会降低种子的发芽率。
六忌贮种不检查。种子贮藏后会因贮藏不当而使种子霉变，或遭鼠害虫蛀而造成损失，应及时检查并采取相应措施。