鸟笼最好天天清，或至少一周一次，细菌比较不会滋生，定时清理消毒，才能够给鸟儿一个干净的环境。以下介绍鸟笼的清理跟消毒方式。
鸟笼清理方式:
有底纹的笼子清理方式:
1.清洗方式:先用水把笼子淋湿，软化便便，一会儿再用刷子稍微刷一下，然后再用水冲一冲，就干干净净了。清洗整个鸟笼包括栖杆、玩具、饲料槽、水槽等所有的器具。尽量只用清水冲刷，如果用稀释过的中性洗洁精，注意一定要大量清水冲洗掉所有的泡沫。冲凉后晒太阳，或用吹风机吹干。
2.底盘的清理:
a.底盘垫料:便盘平时铺上报纸、广告纸、卫生纸、木屑、猫砂，有便便时可方便常更换。
b.换底网:如果你家的鸟笼底网是可拆卸的话，可以直接把底网拿起来清理，换上新的底网即可。
c.如何应付爱咬底盘报纸的鸟儿:若鸟儿会把底下的报纸或广告纸咬起来的话，建议不要铺报纸而采用鸟砂，或者底盘不铺东西，每日清洗底盘，做好消毒即可，消毒方式可参考下列的内容。也可以在铺上报纸或广告纸之后，再黏上胶带固定住纸张，就比较不会被鸟儿拉去咬碎。
没有底纹的笼子清理方式:
1.使用贝壳沙（鸟砂）:鸟砂可以包裹住便便，鸟儿不会沾染到粪便，平时把被鸟砂包覆的便便清掉，全部的鸟砂一周换一次即可，但建议是使用在深度1.5cm以上的底盘。
2.铺些卫生纸或是木屑，可吸收便便，但这两种垫料的吸水度跟干净度较鸟砂差。
鸟笼消毒方式:
一般消毒方式:
1.如前所述，以清水和刷子把鸟儿冲刷干净，再拿去太阳下曝晒即可。若使用热水来清洗鸟笼的话，消毒效果更好。
2.稀释的漂白水:建议使用成份是次氯酸钠的漂白水，要稀释到浓度为2%—5%，才是安全的范围，但是因为漂白水有刺鼻的味道，以漂白水清洁笼子的时候，必须把鸟儿移开。以漂白水清洁一次笼子之后，还要以清水冲洗数遍之后，才能让鸟儿住进笼子内。
3.稀释的酒精:酒精消毒以70～75%最有效，只要等挥发完毕即可，若不太安心，也可以用清水冲过之后再把鸟儿移入。酒精一样有刺鼻的味道，必须避免鸟儿闻到此种气味，否则会有不良影响。
4.稀释优碘:优碘有分清洁用的和消毒伤口用的，清洁用的会起泡泡，可以直接拿来清洗鸟笼，至于消毒伤口用的则要稀释后使用。无论是在气味或安全性上，优碘都比漂白水和酒精更好。
除了第一点以外，以上提到的三种消毒产品，都可以在鸟儿移出鸟笼后，把产品稀释后直接用来冲洗鸟笼，或者也可以将消毒产品装在喷雾罐内，喷洒在已洗净的鸟笼上，若用漂白水一定要用清水冲过，再拿去晒太阳，干了之后即可把鸟儿移入笼内。
专业消毒产品:
1.鸟用消毒液:通常成份含驱虫药材和各类消毒水，所以有一股浓郁呛鼻的中药味，有的消毒液也能喷在鸟儿羽毛上，有保护的功能。
2.virkons（卫可）:为一做过数百个研究和测试报告、有专利的清洁剂，杀灭真菌、细菌、小型病毒.无污染和残留问题，提供给鸟友们做参考。
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