养殖密度过大 这是普遍存在的一个问题。养殖户片面追求单位面积的产量，多数采用高密度养殖的方法，每层网笼放苗100－120粒，甚至更高。目前扇贝的养殖方法大多采用垂下式，水体交换能力差，大量的排泄物不能及时扩散，沉积在养殖筏周围的海底，并发生腐烂，产生有害物质。当风浪增大时，这些有害物质泛起，毒害扇贝。另一方面，养殖密度过高致使饵料生物骤减，扇贝因缺乏饵料，抗病能力和抵御环境恶化能力下降，导致扇贝大量死亡。
风浪影响 海区多台风，且集中在8－10月份，此时扇贝缺少足丝。由于风浪的冲击，扇贝在笼内滚动、碰撞，并且相互绞合，导致受伤、死亡。