设施渔业优势特征适应了渔业新阶段发展要求，具有很强的生命力和广阔的发展前景。
首先，设施渔业符合我国国情和资源现状。虽然我国濒临海洋，但总体上是一个内陆农业大国，特别在中西部，水资源短缺是制约农业和渔业发展的主要因素之一。发展设施渔业，利用有限的淡水资源生产更多的水产品，可以满足市场多样化需求，有利于不断提高人民的生活水平。同时，随着新的海洋制度的建立，中日、中韩渔业协定生效，海洋渔业特别是捕捞业正面临生产空间缩小、资源衰退、渔区劳动力转产转业任务繁重等严峻形势，发展设施渔业是解决海洋捕捞业出路问题，促进东部渔业增效、渔民增收、渔区稳定的重要途径。
其次，设施渔业顺应了新阶段渔业发展趋势。在当今经济全球化的新形势下，传统渔业难以适应市场对水产品优势化和多样化的要求。设施渔业打破了以分散的家庭小规模经营为主体的形式，经营手段实现了现代化，渔业运作方式走上了企业化，渔民已不再是原来意义上的渔民，而是能够熟练驾驭市场渔业的企业家，或者是渔业产业化经营中的渔业工人，有利于拉长渔业产业链条，实现产品生产多环节增值，从市场中获得规模效益。
第三，设施渔业适应了市场对产品优质化、多样化需求。设施渔业生产各种无污染、安全、优质的绿色健康食品，符合我国餐桌经济的发展趋势和人们对食品的消费时尚。同时，设施渔业实行特种水产品反季节生产，超、延时令均衡上市供应，在市场上与一般水产品形成错位竞争，避免了传统水产品短时期集中上市的弊端，既提高了渔业竞争力，也增加了效益。
第四，发展设施渔业是我国渔业应对加入ＷＴＯ挑战的需要。目前，我国棉花、玉米等主要农产品价格高于国际市场２０%－４０%，而水产品价格则普遍低于国际市场价格４０%左右，入世后我国农产品关税降至１４.５%，政府对渔业的保护性政策也将取消，使国内水产品市场面临很大挑战。发展设施渔业，可以吸引外资和引进先进技术，生产特色、优质、高附加值、高科技含量的水产品，提高产品的国际竞争能力，有效抵御外国水产品的冲击，同时，使我国的水产品打入国际市场。